自動激光焊接機并非無所不能。在看到其優越的加工性能的同時，也應注意其自身的局限性，如加工材料的性能限制、嚴格的加工規范要求等。自動激光焊接機不建議長期焊接鋁、銅等稀有金屬材料，因為這些材料屬于高反射材料（表明：高反射與板切割表面光滑度無關，主要是因為激光波長不在這些材料的理想吸收范圍內，吸收效果不好，大部分能量反射，容易損壞激光頭前的保護鏡頭），長期使用效果不好，會增加耗材的使用。

自動激光焊接機的激光同一般的光一樣具有生物效應(熟效應、光效應、壓力效應以及電磁場效應)，這種生物效益在給人類帶來益處的同時，若無防護或防護不好也會對如眼睛、皮膚以及神經系統等人體組織造成直接或間接的損害。為了確保激光焊接時的安全與防護，必須對激光危害嚴加控制，做好工程控制、個人防護及安全管理。

1、工程控制：工程控制是指對自動激光焊接機激光器或激光加工系 統在結構上所采取的安全措施，主要包括：防護罩——用以防止工作人員接受超過最大允許照射量;安全連鎖——指與防護罩相連的、在移開防護罩時可避免輻射的 自動裝置;安全光路——對輻照可能引起燃燒或次級輻射的光路予以封閉;鑰匙開關——泛指取下鑰匙時，激光器轉;光束終止——為了使激光束不超越受控的加工作業區，可使用光束終止器或衰減器。

2、個人防護：主要指穿戴耐火、耐熱的激光防護服，配戴能夠選擇性地衰減特定激光波長的激光防護眼鏡、配戴用于紫外激光源的激光防護面罩、配戴可避免直射或散射激光造成損害的激光防護手套。

3、安全管理：安全管理主要包括設置專門機構或人員，明確職責、權利：包括安全培訓監督等。